Kľúčový rozdiel medzi D a L glukózou je ten, že v D-glukóze sú tri hydroxylové skupiny a jedna vodíková skupina na pravej strane, zatiaľ čo v L-glukóze sú tri hydroxylové skupiny a jedna vodíková skupina na ľavej strane.
Označenie písmen „D“a „L“v názvoch D-glukózy a L-glukózy sa používa na rozlíšenie štrukturálnych rozdielov v molekule glukózy. Tieto dve formy sa nazývajú enantioméry, pretože ich molekulárne štruktúry sú navzájom zrkadlovými obrazmi. Kľúčový rozdiel medzi D a L glukózou preto spočíva v ich štruktúre. Rozdiely v ich tvaroch môžeme vysvetliť pomocou Fisherovho projekčného modelu; je to jeden zo spôsobov, ako čerpať organické molekuly.