Kľúčovým rozdielom medzi vakuolami a vezikulami je to, že vakuoly sú veľké vaky viazané na membránu, ktoré sa používajú na skladovanie, zatiaľ čo vezikuly sú malé vaky viazané na membránu, ktoré sa používajú na skladovanie a transport do vnútra eukaryotických buniek.
Bunka je ako vrece s chemikáliami, ktoré je schopné prežiť a samo sa replikovať. Bunková membrána oddeľuje vnútro bunky od vonkajšieho prostredia v živočíšnych bunkách. Preto je v bunkách rastlín bunková stena vonkajšou hranicou, ktorá oddeľuje vnútro bunky od vonkajšieho prostredia. Bunka spravidla obsahuje vo svojej cytoplazme rôzne druhy organel. Tieto organely zahŕňajú jadro, Golgiho aparát, mitochondrie, endoplazmatické retikulum, ribozómy, centrioly, vezikuly atď.