Kľúčový rozdiel medzi endotelom a mezoteliom je v tom, že endotel je jednoduchá vrstva plochých epiteliálnych buniek, ktorá lemuje celý obehový systém vrátane krvných ciev, lymfatických ciev a srdca, zatiaľ čo mezotel je jednoduchá vrstva plochých epiteliálnych buniek, ktorá lemuje hlavné telesné dutiny, ako napr. pobrušnice, pleury a perikardu.
Epitel, mezotel a endotel sú tri typy bunkových vrstiev, ktoré lemujú naše vnútorné orgány, telové dutiny a pokožku. Preto sú všetky ochrannými bariérami tela. Štrukturálne sú mezotel a endotel špecializované alebo upravené epiteliálne vrstvy mezodermálneho pôvodu. Podľa toho sú tvorené jednoduchými plochými epiteliálnymi bunkami. Mesotel aj endotel sú jednovrstvové tkanivá. Lemujú určité vnútorné povrchy.