Kľúčový rozdiel medzi hydrofóbnymi a hydrofilnými aminokyselinami je v tom, že hydrofóbne aminokyseliny sú nepolárne, zatiaľ čo hydrofilné aminokyseliny sú polárne.
Aminokyseliny sú stavebnou jednotkou bielkovín. Proteín je obrovská molekula polyméru, ktorá je nevyhnutnou súčasťou všetkých živých organizmov. Aminokyseliny sú navyše hlavne v dvoch typoch ako esenciálne a neesenciálne aminokyseliny. Ďalej ich môžeme klasifikovať ako hydrofilné a hydrofóbne aminokyseliny, v závislosti od ich fyzikálno-chemickej povahy. Líšia sa od seba hlavne na základe polarity.
