Kľúčovým rozdielom medzi peptidom a dipeptidom je, že peptid je krátky reťazec aminokyselín, ktoré sa navzájom spájajú prostredníctvom peptidových väzieb, zatiaľ čo dipeptid je forma peptidu, ktorý má buď dve aminokyseliny spojené jednou peptidovou väzbou, alebo jednu aminokyselinu s dve peptidové väzby.
Aminokyseliny sú stavebnou jednotkou bielkovín. Preto navzájom vytvárajú peptidové väzby a vytvárajú krátke reťazce aminokyselín; nazývame ich „peptidy“. Dlhé a spojité peptidové reťazce sú „polypeptidy“. Tieto polypeptidové reťazce sa navzájom spájajú a vytvárajú proteíny. Pojem peptid je bežný pojem, ktorý používame na pomenovanie krátkeho reťazca aminokyselín, ale výraz dipeptid je špecifický pojem, ktorý používame na pomenovanie konkrétneho typu peptidov.
