Peptid vs proteín
Aminokyseliny, peptidy a proteíny sa často označujú ako príbuzné výrazy, napriek tomu sa líšia svojimi charakteristikami. Aminokyseliny sú stavebnou jednotkou peptidov aj bielkovín. Aminokyselina je malá molekula, ktorá obsahuje aminoskupinu (NH 2) a má skupinu karboxylovej kyseliny (-COOH), ktoré sú viazané na centrálnej atóm uhlíka, s prídavným vodíkom a postranný reťazec (R skupina). Tento bočný reťazec sa líši medzi všetkými aminokyselinami; teda určuje jedinečné znaky a chémiu každej aminokyseliny. Konkrétna génová sekvencia sa používa na stanovenie aminokyselinovej sekvencie ako v peptidoch, tak v proteínoch.
Peptid
Peptidy sú tvorené dvoma alebo viacerými aminokyselinami, ktoré sú spojené peptidovými väzbami a sú prítomné ako lineárne reťazce. Dĺžka peptidu je určená množstvom aminokyselín v ňom. Obvykle je dĺžka peptidu menšia ako približne 100 aminokyselín.
Predpony sa používajú na všeobecný opis terminológie peptidov. Napríklad, keď je peptid vyrobený z dvoch aminokyselín, nazýva sa dipeptid. Takto sa tri aminokyseliny skombinujú za vzniku tripeptidov, štyri aminokyseliny sa spoja za vzniku tetrapeptidov atď. Okrem týchto typov existujú oligopeptidy (tvorené 2 až 20 aminokyselinami) a polypeptidy, ktoré obsahujú veľa peptidov (menej viac ako 100). Najdôležitejšie charakteristické vlastnosti peptidov sú určené množstvom a sekvenciou aminokyselín.
Primárnou funkciou väčšiny peptidov je umožniť efektívnu komunikáciu prenášaním biochemických správ z jedného miesta na druhé v tele.
Bielkoviny
Proteíny sú najrozmanitejšou skupinou biologických makromolekúl. Proteín sa skladá z jedného alebo viacerých dlhých nerozvetvených reťazcov nazývaných polypeptidy, a napriek tomu sú stavebnými blokmi proteínov aminokyseliny. Sekvencia aminokyseliny určuje hlavné charakteristiky proteínu, zatiaľ čo táto aminokyselinová sekvencia je definovaná konkrétnou génovou sekvenciou.
Obvykle majú proteíny stabilné trojrozmerné štruktúry. O týchto štruktúrach možno diskutovať z hľadiska hierarchie štyroch úrovní; primárne, sekundárne, terciárne a kvartérne. Primárna štruktúra je aminokyselinová sekvencia proteínu. Sekundárna štruktúra sa produkuje tvorením vodíkových väzieb medzi dvoma blízkymi aminokyselinami, čím vznikajú štruktúry nazývané β-plátované listy a cievky nazývané α-helixy. Oblasti sekundárnej štruktúry sa potom ďalej prehýbajú v priestore, aby vytvorili konečné trojrozmerné štruktúry proteínu. Usporiadanie viacerých polypeptidov v priestore vedie k kvartérnej štruktúre proteínu.
Hlavné funkcie proteínov sú enzýmová katalýza, obrana, transport, podpora, pohyb, regulácia a ukladanie.
Aký je rozdiel medzi peptidom a proteínom?
• Peptidy sú krátke lineárne reťazce aminokyselín, zatiaľ čo bielkoviny sú veľmi dlhé reťazce aminokyselín.
• Niekoľko aminokyselín je spojených dohromady za vzniku peptidu peptidovými väzbami, zatiaľ čo niekoľko peptidov je spojených dohromady za vzniku proteínových molekúl.
• Normálne majú proteíny stabilné trojrozmerné štruktúry. Naproti tomu peptidy nie sú usporiadané v stabilnej trojrozmernej štruktúre.
• Dĺžka peptidu je menej ako približne 100 aminokyselín, zatiaľ čo dĺžka bielkoviny je viac ako 100 aminokyselín. (Existujú výnimky; rozdiely sa teda viac spoliehajú skôr na funkciu molekúl ako na ich veľkosť)
• Na rozdiel od peptidov sa proteíny považujú za makromolekuly.
• V peptidoch tvoria iba bočné reťazce aminokyselín vodíkové väzby. Zatiaľ čo v proteínoch tvoria nielen bočné reťazce, ale aj peptidové skupiny vodíkové väzby. Tieto vodíkové väzby môžu byť s vodou alebo s inými peptidovými skupinami.
• Všetky peptidy existujú ako lineárne reťazce, zatiaľ čo proteíny môžu existovať ako primárne, sekundárne, terciárne a kvartérne.
