Rozdiel medzi Embden Meyerhof Pathway a Entner Doudoroff Pathway je ten, že Embden Meyerhof Pathway je klasická glykolýza, ktorá premieňa glukózu na pyruvát u eukaryotov a mnohých prokaryotov. Entner Doudoroff Pathway je zároveň alternatívnou cestou glykolýzy u niekoľkých baktérií a prevádza glukózu na pyruvát za účelom produkcie ATP.
Glykolýza je prvý stupeň bunkového dýchania, ktorý premieňa glukózu na pyruvát. Počas glykolýzy nastáva rad reakcií. Generuje tiež dve molekuly ATP ako čistú produkciu. Cesta Embden Meyerhof je synonymom glykolýzy. glykolýza sa vyskytuje u eukaryotov a mnohých prokaryotov a používajú glukózu na generovanie ATP. Ale u určitých prokaryotov, najmä u určitých baktérií, existuje alternatíva pre glykolýzu. Táto cesta je známa ako Entner Doudoroff Pathway. Cesta Entner Doudoroff teda nahrádza klasickú glykolýzu u niekoľkých druhov baktérií.