Kľúčovým rozdielom medzi oligopeptidom a polypeptidom je, že oligopeptidy obsahujú niekoľko aminokyselinových zvyškov, zatiaľ čo polypeptidy obsahujú veľké množstvo aminokyselinových zvyškov.
Pojmy oligopeptidy a polypeptidy spadajú do kategórie proteínov. Peptidy sú krátke reťazce aminokyselín. Aminokyseliny sa navzájom viažu prostredníctvom peptidových väzieb. Preto môžeme tieto peptidy kategorizovať podľa počtu aminokyselín prítomných v týchto peptidoch. Napr. Dipeptidy, tripeptidy, tetrapeptidy, oligopeptidy a polypeptidy.
