Agaróza vs polyakrylamid
Agaróza a polyakrylamid sú oba vo vode rozpustné polyméry, ale medzi nimi je vidieť veľa rozdielov, počnúc ich pôvodom. Agaróza aj polyakrylamid majú niečo spoločné v schopnosti vytvárať porézne gélové matrice. Napriek tomu medzi nimi existuje niekoľko zreteľných rozdielov. Hlavné rozdiely medzi oboma týmito polymérmi spočívajú v ich povahe pôvodu, chemickej štruktúre, ich rozdielnom použití a výkone v zmysle gélovej elektroforézy.
Čo je agaróza?
Agaróza je prirodzene sa vyskytujúci lineárny polymér, ktorý je zase odvodený od komplexného polyméru nazývaného agar, ktorý sa nachádza v morských riasach. Agaróza sa extrahuje z agaru odstránením jej proteínovej zložky nazývanej agaropektín. Agaróza je to, čo dáva agaru schopnosť vytvárať gély.
Hlavné použitie agarózy je v mikrobiologických a molekulárno-biologických štúdiách. V mikrobiologických štúdiách poskytuje agaróza doplnená vhodnými živinami pevný základ pre kultiváciu mikroorganizmov, ako sú baktérie a huby. Ak sa použije v polotuhých koncentráciách, môže byť užitočné pri hodnotení motility týchto mikroorganizmov. V molekulárnej biológii slúži ako dôležitý nástroj pre jeden z najzákladnejších procesov rozlíšenia nazývaných „gélová elektroforéza“alebo „agarózová gélová elektroforéza“(AGE). Gélová elektroforéza je proces, ktorý umožňuje rozlíšenie alebo separáciu nukleových kyselín alebo proteínov na základe ich veľkosti a náboja. Agaróza tu slúži ako pórovitý gél podobný sitku, cez ktorý dochádza k separácii.
Agarózová štruktúra
Čo je polyakrylamid?
Polyakrylamid je syntetický polymér a používa sa v širokej škále priemyselných odvetví. Ako už bolo spomenuté vyššie, jeho použitie sa spolieha na jeho schopnosť vytvárať gély. Okrem toho sa však jeho schopnosť zadržiavať a odvádzať vodu v rôznych koncentráciách využíva aj v rôznych priemyselných odvetviach.
Najbežnejšie a najbežnejšie použitie polyakrylamidu je pri čistení odpadových vôd. Tu sa používa ako flokulačná látka na odstránenie suspendovaného organického materiálu; teda zlepšenie zákalu a čistenie vody. Ďalšie použitie polyakrylamidu je v papierenskom priemysle. Tu sa používa na zadržiavanie alebo vypúšťanie vody z papierovej buničiny podľa potreby. Podobne sa v poľnohospodárskom a stavebnom priemysle používa ako pôdny kondicionér na zabránenie pôdnej erózii a zlepšenie jej kvality.
Rovnako ako agaróza sa aj polyakrylamid používa v molekulárnej biológii ako dôležitý nástroj na rozlíšenie v podobnom procese nazývanom „polyakrylamidová gélová elektroforéza“(PAGE). Okrem toho všetkého sa polyakrylamid používa aj pri spracovaní rúd a výrobe flokulačného činidla na odstránenie suspendovaného organického materiálu; teda zlepšenie zákalu a čistenie vody. Ďalšie použitie polyakrylamidu je v papierenskom priemysle. Tu sa používa na zadržiavanie alebo vypúšťanie vody z papierovej buničiny podľa potreby. Podobne sa v poľnohospodárskom a stavebnom priemysle používa ako pôdny kondicionér na zabránenie pôdnej erózii a zlepšenie jej kvality. Okrem toho všetkého sa polyakrylamid používa aj na výrobu potravinárskych prísad, mäkkých kontaktných šošoviek a textílií.
Štruktúra polyakrylamidu
Aký je rozdiel medzi agarózou a polyakrylamidom?
Pôvod agarózy a polyakrylamidu:
Agaróza: Agaróza je polymér prírodného pôvodu. Je odvodený z morských rias.
Polyakrylamid: Polyakrylamid je syntetického pôvodu a nenachádza sa za žiadnych prírodných okolností.
Molekulárny vzorec agarózy a polyakrylamidu:
Agaróza: Molekulárna vzorec agarózy je C 24 H 38 O 19.
Polyakrylamid: Molekulárna vzorec polyakrylamidu je (C 3 H 5 NO) n.
Chemická štruktúra agarózy a polyakrylamidu:
Agaróza: Agaróza je lineárny polysacharid. Skladá sa z opakujúcich sa disacharidových jednotiek nazývaných agrobióza, ktoré sú spolu držané vodíkovými väzbami.
Polyakrylamid: Polyakrylamid je chemicky zosieťovaný polymér. Je vyrobený z akrylamidových monomérov a zosieťovacieho činidla N, N'-metylénbisakrylamidu.
Toxicita agarózy a polyakrylamidu:
Agaróza: Agaróza aj jej monomérna jednotka agrobióza sú netoxické.
Polyakrylamid: Monomérna jednotka polyakrylamidu, akrylamid, je predpokladaným karcinogénom a známym neurotoxínom, zatiaľ čo v polymerizovanej forme je netoxická.
Vlastnosti agarózových a polyakrylamidových gélov:
VEK a STRÁNKA:
Agaróza: Príprava agarózového gélu na AGE je menej časovo náročná, ľahká a jednoduchá a nevyžaduje iniciátor ani polymerizačný katalyzátor.
Polyakrylamid: Príprava polyakrylamidového gélu pre PAGE je časovo náročná a zdĺhavá a vyžaduje tiež iniciátor (persíran amónny) a polymerizačný katalyzátor (N, N, N ', N'-tetrametyletylendiamín - TEMED).
Príroda:
Polyakrylamidové gély sú chemicky stabilnejšie ako agarózové gély.
Veľkosť pórov:
Pri rovnakej koncentrácii majú polyakrylamidové gélové matice tendenciu mať menšie veľkosti pórov v porovnaní s maticami agarózového gélu.
Zmena veľkosti pórov:
Veľkosť pórov polyakrylamidových gélov sa môže meniť kontrolovanejšie ako u agarózových gélov.
Rozlišovacia sila:
Polyakrylamidové gély majú vysokú rozlišovaciu schopnosť, zatiaľ čo agarózové gély majú nízku rozlišovaciu schopnosť.
Ubytovanie nukleových kyselín:
Polyakrylamidové gély môžu kvôli rozlíšeniu pojať väčšie množstvo nukleovej kyseliny ako agarózové gély.
Obrázky so zdvorilosťou: Agaróza a štruktúra polyakrylamidu cez Wikicommons (Public Domain)
