Kľúčovým rozdielom medzi aloštepom a autotransplantátom je, že aloštep je kostný štep odobratý darcovi (inej osobe), zatiaľ čo autotransplantát je kostný štep odobratý samotnému pacientovi.
Aloštep a autotransplantát sú dva bežné typy ľudských kostných štepov používaných na postupy podávania štepov na hojenie kostných poranení. V závislosti od poranenia chirurgovia vyberú vhodný štep pre operáciu. Autotransplantát pochádza z tela pacienta sám, zatiaľ čo aštep je od darcu. Úspešnosť operácie s autotransplantátom je vyššia ako v prípade operácie s aštepom. Riziko infekcie je navyše vysoké aj pri operáciách aloštepov ako pri autotransplantátoch.