Kľúčový rozdiel medzi HPLC na reverznej fáze a normálnou fázou spočíva v tom, že HPLC na reverznej fáze používa nepolárnu stacionárnu fázu a polárnu mobilnú fázu, zatiaľ čo HPLC s normálnou fázou používa polárnu stacionárnu fázu a menej polárnu mobilnú fázu.
Normálna fázová HPLC je najstaršou technikou HPLC, ktorú Tswett použil pri separácii rastlinných extraktov; použil kriedu v sklenenom stĺpci. Toto bol klasický spôsob chromatografie, ktorý viedol k pomenovaniu ako „normálna“technika. HPLC na reverznej fáze je na druhej strane opakom bežnej techniky, ktorú vedci vyvinuli v poslednej dobe.
