Kľúčovým rozdielom medzi ATPázou typu V a F je, že ATPáza typu V funguje ako iónová pumpa poháňaná ATP, zatiaľ čo ATPáza typu F funguje ako ATP syntáza v bunkách.
ATPáza je termín, ktorý označuje enzýmy, ktoré sú schopné hydrolyzovať ATP. Všeobecne sa ATPázy rozkladajú ATP a energia uvoľnená počas reakcie sa využíva na prácu, pretože ATP je energetická mena, ktorá poskytuje energiu všetkým bunkovým procesom. Rozdelenie ATP vyžaduje ATPázy. Preto ATPázy znižujú aktivačnú energiu hydrolýzy ATP. Existujú štyri hlavné typy ATPáz, ako sú F-ATPázy, V-ATPázy, A-ATPázy a P-ATPázy. ATPázy typu V sa primárne nachádzajú vo vakuolách eukaryotických buniek. Naproti tomu ATPázy typu F sa nachádzajú v bakteriálnych plazmatických membránach, vnútornej membráne mitochondrií a chloroplastoch. Katalyzujú hydrolýzu alebo syntézu spojenia ATP s transportom H + (alebo Na +) cez membránu.
