Kľúčovým rozdielom medzi CRISPR a reštrikčnými enzýmami je, že CRISPR je prirodzene sa vyskytujúci prokaryotický imunitný obranný mechanizmus, ktorý sa nedávno použil na úpravu a modifikáciu eukaryotických génov, zatiaľ čo reštrikčné enzýmy sú biologické nožnice, ktoré štiepia molekuly DNA na menšie látky.
Úpravy genómov a modifikácie génov sú zaujímavé a inovatívne oblasti v genetike a molekulárnej biológii. Štúdie génovej terapie široko využívajú modifikáciu génov. Okrem toho je modifikácia génu užitočná pri identifikácii vlastností génu, funkčnosti génu a toho, ako by mutácie v géne mohli ovplyvniť jeho funkciu. Je dôležité odvodiť účinné a spoľahlivé spôsoby, ako vykonať presné a cielené zmeny v genóme živých buniek. CRISPR a reštrikčné enzýmy zohrávajú kľúčovú úlohu v modifikáciách génov. CRISPR modifikuje gény s vysokou presnosťou. Reštrikčné enzýmy fungujú ako biologické nožnice, ktoré štiepia molekuly DNA na menšie látky.