Kľúčový rozdiel medzi metaloenzýmami a enzýmami aktivovanými kovom je ten, že metaloenzýmy majú ako kofaktor pevne viazaný ión kovu, zatiaľ čo kovové ióny v enzýmoch aktivovaných kovom nie sú pevne viazané.
Aktivita niektorých enzýmov závisí od iónov kovov, pretože tieto ióny kovov pôsobia ako kofaktory. Tieto enzýmy sú v dvoch hlavných kategóriách ako metaloenzýmy a kovom aktivované enzýmy. Preto sa tieto enzýmy navzájom líšia podľa prítomnosti alebo neprítomnosti pevne viazaných iónov kovov. Poďme diskutovať o ďalších podrobnostiach o týchto enzýmoch.