Kľúčovým rozdielom medzi aktívnou a pasívnou difúziou je, že aktívna difúzia alebo aktívny transport využíva energiu na transport molekúl proti koncentračnému gradientu, zatiaľ čo pasívna difúzia energiu nepotrebuje, pretože sa vyskytuje pozdĺž koncentračného gradientu.
Existujú rôzne typy dopravných systémov, ktoré pomáhajú pri presune látok z jedného miesta na druhé. V zásade existujú dva mechanizmy prepravy; sú to aktívny a pasívny transport alebo difúzia. Hlavným kritériom pre rozdiel medzi aktívnou a pasívnou difúziou je spotreba energie. Aktívna doprava spotrebúva energiu, zatiaľ čo pasívna doprava nevyžaduje energiu. Ďalej existuje ešte viac rozdielov medzi aktívnou a pasívnou difúziou. Hlavným účelom tohto článku je diskutovať o týchto rozdieloch a zároveň porozumieť týmto dvom mechanizmom.