Kľúčový rozdiel medzi flórou a faunou spočíva v tom, že flóra sa týka života rastlín v konkrétnom regióne, zatiaľ čo fauna sa týka života zvierat v konkrétnom regióne.
Flóra a fauna sú dva všeobecné výrazy, ktoré sa používajú na označenie rastlín a živočíchov v konkrétnom regióne. Pretože flóra predstavuje všetky rastliny, môžeme povedať, že zahŕňa všetky nepohyblivé autotrofné fotosyntetické organizmy. Podobne môžeme povedať, že fauna zahŕňa všetky mobilné heterotrofné organizmy, ktoré sú od potravinových zdrojov závislé od ostatných. Preto sa tieto slová flóra a fauna väčšinou používajú spoločne na opísanie života rastlín a zvierat v regióne alebo oblasti. Flóra aj fauna konkrétneho miesta sú dôležité z niektorých dôvodov, najmä z ekologických dôvodov. Rastliny, ako aj živočíchy pôvodné z určitého miesta, udržiavajú ekologickú rovnováhu a vedci sledujú všetky druhy, aby zistili, či niektorému z týchto druhov nehrozí vyhynutie. Vedci a ochrancovia životného prostredia potom v úzkej spolupráci navrhujú metódy na obnovenie tejto chúlostivej ekologickej rovnováhy.