Kľúčový rozdiel medzi acidofilnými a bazofilnými je v tom, že acidofilné zložky bunky milujú kyseliny a na ich farbenie sa používajú kyslé farbivá, zatiaľ čo bazofilné zložky bunky milujú bázu a na ich farbenie sa používajú zásadité farbivá.
Farbenie je technika používaná na vizualizáciu buniek a ich komponentov, pretože veľa buniek je bezfarebných a priehľadných. Niektoré zložky bunky sú milujúce kyseliny, zatiaľ čo niektoré časti milujú zásady. Kyslé a základné farbivá sú dva typy farbív, ktoré sa často používajú pri uvádzaní postupov. Bazofilné farbenie používa základné farbivá, zatiaľ čo acidofilné farbenie používa kyslé farbivá. Preto sa acidofilné alebo kyselinou milujúce zložky viažu s kyslými farbivami, zatiaľ čo bazofilné alebo bázou milujúce zložky sa viažu s bázickými farbivami.
