Kľúčovým rozdielom medzi prostaglandínmi a leukotriénmi je, že prostaglandíny produkujú všetky typy buniek a všetky časti tela, ktoré sa zaoberajú úrazmi a chorobami, zatiaľ čo leukotriény sú produkované leukocytmi.
Eikosanoidy sú rodinou bioaktívnych lipidových mediátorov. Sú to okysličené 20-uhlíkové mastné kyseliny syntetizované z diétnych esenciálnych mastných kyselín. Podieľajú sa na regulácii radu fyziologických a patologických reakcií. Okrem toho vykazujú silné zápalové vlastnosti a pomáhajú pri vývoji a regulácii imunologických a zápalových reakcií. Prostaglandíny a leukotriény sú dva typy eikozanoidov pochádzajúcich z kyseliny arachidónovej. Prostaglandíny zvyšujú účinky histamínu a bradykinínu na vaskulárnu permeabilitu, zatiaľ čo leukotriény sprostredkovávajú akumuláciu leukocytov počas akútneho zápalu.