Kľúčovým rozdielom medzi E. coli a Klebsiellou je, že E. coli je gramnegatívna tyčinkovitá baktéria, ktorá je pohyblivá, zatiaľ čo Klebsiella je rod gramnegatívnych tyčinkovitých baktérií, ktorý nie je pohyblivý.
Escherichia a Klebsiella sú dva bežné rody koliformných baktérií. Oba rody pozostávajú z gramnegatívnych tyčinkovitých baktérií, ktoré nespórujú. E. coli je druh Escherichia. Je to pohyblivá fekálna koliformná baktéria. Baktérie E. coli aj Klebsiella patria do čeľade Enterobacteriaceae. Sú súčasťou normálnej flóry v našich črevách. Ďalej sú to fakultatívne anaeróby. Oba sú všeobecne neškodné, ale v určitých situáciách sa z nich stávajú oportunistické ľudské patogény.