Kľúčový rozdiel medzi prostaglandínom E1 a E2 je ten, že prostaglandín E1 (PGE1) je protizápalový faktor, zatiaľ čo prostaglandín E2 (PGE2) je prozápalový faktor.
Prostaglandíny sú zlúčeniny odvodené od lipidov, ktoré majú funkciu podobnú hormónom. Môžu pôsobiť ako autokrinné alebo parakrínové zlúčeniny, ktoré majú antagonistické alebo synergické účinky na živé organizmy. Prostaglandín E1 a prostaglandín E2 sú dva typy a líšia sa funkciou zápalu. Prostaglandín E1 aj E2 patria do rovnakej rodiny prostaglandínu E2 a ich základ reakcie a ich účinky ešte nie sú úplne objasnené. Používajú sa pri liečbe rôznych biochemických mechanizmov u živých bytostí.