Kľúčovým rozdielom medzi Harrisom a Mayerovým hematoxylínom je to, že Harrisov hematoxylín sa používa pri regresívnom farbení, zatiaľ čo Mayerov hematoxylín sa používa pri progresívnom farbení.
Hematoxylín je základné farbivo, ktoré sa bežne používa v histopatológii. Je to prírodné farbivo extrahované zo stromu Haematoxylon campechianum. Je to tmavomodré alebo fialové farebné farbivo. Hematoxylín umožňuje demonštráciu mikroskopických jadrových detailov bunkových a tkanivových zložiek. Toto farbivo je pozitívne nabité, preto sa viaže s negatívne nabitými látkami, ako sú DNA a RNA, a farbí ich fialovými farbami. Hematoxylín vyžaduje moridlo, ktoré pomáha spojeniu so zložkami tkaniva. Moridlo je chemikália, najmä soľ hliníka, železa, volfrámu, ktorá uľahčuje spojenie farbiva s tkanivovou zložkou.
Na základe moridiel, ktoré obsahujú, je k dispozícii niekoľko druhov hematoxylínov. Niektoré z nich sú hematoxylíny Ehrlicha, Mayera, Harrisa, Gilla, Delafielda, Cole a Carazziho. Harrisove aj Mayerove formulácie hemoxylínu sú moriace hematoxylíny na báze hliníka.