Kľúčový rozdiel medzi medzidruhové a vnútrodruhové hybridizácie je, že medzidruhové hybridizácia nastáva medzi dvoma prepojenými jednotlivcami, ktoré patria do dvoch rôznych druhov, pričom dôjde k vnútrodruhová hybridizácia medzi geneticky odlišnými dvoch jedincov rovnakého druhu.
Hybridizácia je proces párenia alebo kríženia geneticky diferencovaných jednotlivcov alebo skupín. Hlavným cieľom hybridizácie je spojiť požadované gény prítomné v rôznych organizmoch. Okrem toho sa hybridizácia používa na produkciu potomkov čistého rozmnožovania. Párenie sa môže uskutočňovať medzi dvoma jedincami rovnakého druhu alebo medzi dvoma jedincami rôznych druhov. Na základe toho existujú dva typy hybridizácie: vnútrodruhová hybridizácia a medzidruhová hybridizácia.