Kľúčovým rozdielom medzi imunosupresiou a imunodeficienciou je to, že imunosupresia sa týka zníženia účinnosti imunitného systému, zatiaľ čo imunodeficiencia sa týka neschopnosti imunitného systému bojovať proti infekčným agensom.
Imunitný systém detekuje široké spektrum infekčných agensov vstupujúcich do nášho tela a chráni nás pred chorobami. Preto je to obranný systém v našom tele. Skladá sa z rôznych typov imunitných buniek. Imunitný systém funguje prostredníctvom dvoch subsystémov: vrodeného imunitného systému a adaptívneho imunitného systému. U zdravého jedinca funguje imunitný systém normálne a zabraňuje vzniku chorôb. Ale keď sú poruchy v imunitnom systéme, nefunguje to aktívne. Imunodeficiencia je taký stav, pri ktorom sa znižuje alebo absentuje schopnosť imunitného systému bojovať proti chorobám; imunosupresia je ďalší stav spojený s imunitným systémom, pri ktorom sa znižuje účinnosť imunitného systému.
