Kľúčový rozdiel medzi glutamínom a L-glutamínom je v tom, že glutamín je aminokyselina, zatiaľ čo L-glutamín je izomér glutamínu.
Aminokyselina je jednoduchá molekula vytvorená s C, H, O, N a možno aj so S. Všetky aminokyseliny majú skupiny –COOH, -NH2 a –H viazané na uhlík. Avšak skupina R sa líši od aminokyseliny k aminokyseline. V najjednoduchšej aminokyseline je skupina R vodík atm; hovoríme tomu glycín. Existuje asi 20 bežných aminokyselín. Niektoré z nich sú pre nás nevyhnutné, zatiaľ čo iné nie sú nevyhnutné. Glutamín je jednou z hlavných neesenciálnych aminokyselín.