Kľúčovým rozdielom medzi protoxylemom a metaxylémom je to, že protoxylem je prvý vytvorený primárny xylém, ktorý má menšie bunky, najmä úzke cievy a tracheidy, zatiaľ čo metaxylem je neskôr vytvorený primárny xylém, ktorý má väčšie bunky, najmä širšie cievy a tracheidy.
Xylem je jedným z dvoch typov vaskulárnych tkanív v rastlinách. Xylem vedie nahor pohyby vody a minerálov od koreňov k iným častiam rastliny. Je to rúrkovitá štruktúra obsahujúca rôzne typy špecializovaných buniek vrátane cievnych prvkov, tracheidov, parenchýmu a vlákien. Existujú dva typy xylémov ako primárny xylém a sekundárny xylém. Primárny xylém sa vyvíja počas primárneho rastu. Ďalej má primárny xylém dve časti: protoxylem a metaxylem. Protoxylem aj metaxylem pochádzajú z prokambia počas primárneho rastu. Ako prvý vzniká protoxylem a po protoxyleme vzniká metaxylem.
