Kľúčový rozdiel medzi nukleotidom a nukleozidom je v tom, že nukleotid obsahuje fosfátovú skupinu, zatiaľ čo v nukleozide chýba fosfátová skupina.
Nukleozidy a nukleotidy sú podobný typ molekúl, ktoré sa líšia miernou štrukturálnou zmenou. Nukleotid aj nukleozid sú zložené z rovnakých dvoch zložiek; pentózový cukor a dusíkatý základ. Ďalej má nukleotid jednu alebo viac fosfátových skupín. Pridaním fosfátovej skupiny teda možno nukleozid premeniť na nukleotid pomocou enzýmov nazývaných kináza. Nukleotid je stavebnou jednotkou nukleových kyselín. Na druhej strane, nukleozidy sú dobré protirakovinové a antivírusové látky.
