Kľúčovým rozdielom medzi chaperónmi a chaperonínmi je to, že chaperóny vykonávajú širokú škálu funkcií vrátane skladania a degradácie proteínu, napomáhania zostavenia proteínu atď., Zatiaľ čo kľúčovou funkciou chaperonínov je pomoc pri skladaní veľkých molekúl proteínu.
Molekulárne chaperóny alebo chaperóny sú proteínové molekuly, ktoré pomáhajú v procese skladania proteínov do zložitých štruktúr. Preto sú chaperoníny typom chaperónu, ktorý zahŕňa proteíny tepelného šoku. Spomedzi všetkých typov chaperónov sú chaperoníny najštudovanejšími proteínmi kvôli dôležitej úlohe, ktorú zohrávajú pri správnom skladaní proteínov. Preto pôsobenie chaperónov a chaperonínov zabraňuje nevratnej agregácii proteínov a tým umožňuje ich funkčnosť. Chaperóny a chaperoníny sa líšia v závislosti od funkčnosti týchto dvoch molekúl.
