Kľúčový rozdiel medzi Caimanom a Aligátorom je v tom, kde žijú. Kajmania žijú v južnej a strednej Amerike, zatiaľ čo aligátori žijú v juhovýchodných štátoch USA a východnej Číne. Líšia sa tiež svojimi podrodinami. Kajman patrí do podčeľade caimaninae, zatiaľ čo aligátor patrí do podčeľade alligatorinae.
Caiman a Alligator sú dvaja krokodíli ako zvieratá. Patria do skupiny plazov. Od krokodílov sa však líšia niekoľkými charakteristikami. Obe zvieratá sú chladnokrvné a žijú v teplom podnebí. Sú to polo-vodné a mäsožravce. Žijú v sladkovodných biotopoch a sú členmi čeľade Alligatoridae. Kajman však patrí do podčeľade caimaninae a aligátor patrí do podčeľade alligatorinae.