Kľúčový rozdiel medzi genetickým materiálom prokaryotov a eukaryotov je ten, že genetický materiál prokaryotov pláva v cytoplazme, pretože nemajú jadro, zatiaľ čo genetický materiál eukaryotov prebýva vo vnútri jadra. Ďalším dôležitým rozdielom medzi tým je, že prokaryoty majú malý genóm a obsahujú plazmidy. Majú tiež veľký stočený dvojvláknový kruhový chromozóm, zatiaľ čo eukaryoty majú väčší genóm a neobsahujú plazmidy.
Prokaryoty a eukaryoty sú dva typy organizmov. Baktérie a Archea sú prokaryoty. Prokaryoty majú jednoduchú bunkovú organizáciu. Nemajú jadro a pravé organely. Na druhej strane, eukaryoty majú zložitú bunkovú organizáciu s jadrom viazaným na membránu a skutočnými organelami. Huby, protisti, rastliny a zvieratá sú eukaryoty.
