Kľúčový rozdiel medzi Cosmidom a Phagemidom je v type sekvencií, ktoré obsahuje. Kozmid obsahuje miesto cos a plazmid. Preto je to hybridný vektor, zatiaľ čo Fagemid je plazmid, ktorý obsahuje F1 počiatok replikácie F1 fágu.
Kozmidy a fagemidy sa používajú na klonovanie, najmä na klonovanie väčších fragmentov DNA. Tieto sa široko používajú najmä pri klonovaní génov zodpovedných za produkciu rôznych proteínov. Kozmidy a fagemidy sa buď replikujú samotné ako plazmidy, alebo sa balia do vírusových častíc a potom sa replikujú.
