Kľúčový rozdiel medzi kandidátskym génom a GWAS je v tom, že prístup kandidátskych génov skúma genetické variácie v malom počte vopred určených génov, ktoré sú predmetom záujmu, zatiaľ čo GWAS skúma celý genóm na zistenie bežných genetických variácií za konkrétnym chorobným stavom.
Kandidátsky génový prístup a genómové asociačné štúdie (GWAS) sú dve metódy, ktoré sú dôležité na zistenie genetickej náchylnosti na choroby. Prístup kandidátskych génov je založený na vopred špecifikovanom malom počte génov, zatiaľ čo GWAS je založený na testovaní celého genómu. Prístup kandidátskych génov preto vyžaduje predchádzajúcu znalosť génov relevantných pre dané ochorenie, na rozdiel od GWAS.
