Kľúčovým rozdielom medzi polyatómovými iónmi a zlúčeninami je, že polyatómové ióny majú buď kladný alebo záporný elektrický náboj, zatiaľ čo zlúčeniny nemajú žiadny čistý elektrický náboj.
Polyatómový ión je pojem, ktorý používame na pomenovanie chemických látok obsahujúcich dva alebo viac atómov, ktoré majú čistý negatívny alebo pozitívny elektrický náboj. Elektrický náboj tohto iónu je výsledkom počtu elektrónov prítomných v každom atóme; ak je elektrónov viac ako celkový počet protónov v atómoch, získa čistý záporný náboj a naopak. Na druhej strane sú zlúčeniny chemické látky bez elektrického náboja. Majú rovnaký počet elektrónov a protónov.
