Kľúčový rozdiel medzi Pseudomonas aeruginosa a Pseudomonas fluorescens spočíva v tom, že P. aeruginosa je oportunistický ľudský patogén, zatiaľ čo P. fluorescens nie je ľudský patogén. Presnejšie povedané, P. aeruginosa je patogén rastlín a živočíchov vrátane človeka, zatiaľ čo P. fluorescence je bakteriálny druh podporujúci rast rastlín. Ďalším dôležitým rozdielom medzi Pseudomonas aeruginosa a Pseudomonas fluorescens je, že P. aeruginosa má schopnosť rásť aj pri 42 ° C.
Pseudomonas je bakteriálny rod, ktorý obsahuje gramnegatívne baktérie v tvare tyčinky a polárne bičíky. Sú to aeróbne baktérie, ktoré sa nevytvárajú spórami, sú pozitívne na katalázu a sú pozitívne na oxidázu. Ďalej tento rod má mnoho druhov vrátane P. aeruginosa, P. fluorescens, P. putida, P. syringae atď.