Kľúčovým rozdielom medzi DNA a RNA nukleotidom je, že DNA nukleotid alebo deoxyribonukleotid obsahuje deoxyribózový cukor, zatiaľ čo RNA nukleotid alebo ribonukleotid obsahuje ribózový cukor.
Nukleotidy sú základnou jednotkou nukleových kyselín. Sú stavebnými kameňmi alebo monomérmi DNA a RNA. Navzájom sa spájajú a vytvárajú polynukleotidový reťazec, ktorý dodáva štruktúru DNA alebo RNA. V nukleotide sú tri hlavné zložky. Sú to dusíkatá báza, pentózový cukor (päť uhlíkových cukrov) a fosfátové skupiny. Existuje päť rôznych dusíkatých báz ako Adenín, Tymín, Cytozín, Guanín a Uracil. Tymín je viditeľný iba v DNA, zatiaľ čo uracil je jedinečný pre RNA. V nukleových kyselinách sú dva druhy piatich uhlíkových cukrov. RNA obsahuje ribózový cukor, zatiaľ čo DNA obsahuje deoxyribózový cukor. Nukleotidy obsahujú tri fosfátové skupiny pripojené k pentózovému cukru.
