Kľúčový rozdiel medzi genokopiou a fenoskopiou je v tom, že v genokopiách vykazujú fenotypy podobnosť a genotyp sa mení, zatiaľ čo vo fenoskopii sa fenotypy líšia a genotyp zostáva nezmenený.
Rozdiel medzi genokopiou a fenoskopiou je súčasťou vysvetlenia zriedkavých výskytov genetiky. Dva koncepty demonštrujú, ako sa môže tradičná genetika alebo mendelovská genetika líšiť na základe výnimiek v prírode. Genoskopia sa týka fenoménu poskytovania podobného fenotypu napriek tomu, že má odlišný genotyp. Naopak, fenoskopia sa týka fenoménu, ktorý má rôzne fenotypy napriek tomu, že genotyp zostáva nezmenený.