Kľúčový rozdiel medzi Apicomplexia a Ciliophora je ten, že Apicomplexia je podskupina prvokov a zahŕňa organizmy s vrcholovým komplexom, zatiaľ čo Ciliophora je ďalší podskupina prvokov, ktorá zahŕňa organizmy s mihalnicami.
Prvoky sú jednou z dvoch hlavných skupín patriacich do kráľovstva Protista. Druhou skupinou sú riasy. Prvoky sú jednobunkové zvieratá, ako sú eukaryotické organizmy. Patria do štyroch tried: Sarcodina (améby), Ciliophora (nálevníky), Zoomastigophora (bičíkovce) a Apicomplexa. Apicomplexia má štruktúru známu ako vrcholový komplex, zatiaľ čo členovia čeľade Ciliophora majú na povrchu organizmu tisíce mihalníc.
