Kľúčovým rozdielom medzi dekantáciou a filtráciou je to, že dekantácia oddeľuje dve zložky v zmesi vyliatím jednej zložky, zatiaľ čo filtrácia oddeľuje dve zložky odfiltrovaním jednej zložky.
Dekantáciou aj filtráciou sa gravitačnou silou oddeľujú dve zložky v zmesi kvapalina-tuhá látka alebo v zmesi dvoch nemiešateľných kvapalín. Filtrácia však na túto separáciu používa filtračný papier alebo iný vhodný filter. Dekantáciou sa však iba odlieva kvapalina, aby sa izolovala pevná látka alebo iná kvapalina v zmesi. Preto je filtrácia najpresnejšou metódou z týchto dvoch spôsobov, ale dekantácia je v niektorých prípadoch tiež užitočná.
