Kľúčový rozdiel - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleázy sú nukleázy, ktoré špecificky degradujú RNA na menšie jednotky. Možno ich rozdeliť do dvoch kategórií; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, ktorá môže degradovať jednovláknovú alebo dvojvláknovú RNA. Štiepi fosfodiesterové väzby v RNA polynukleotidovom reťazci. Príklady sú RNáza A, RNáza III, RNáza T1, RNáza P a RNáza H. Exoribonukleáza je exonukleáza, ktorá degraduje RNA odstránením koncových nukleotidov buď z 5 'konca alebo 3' konca molekuly RNA. Príklady sú RNáza R, RNáza II, RNáza D a RNáza PH. Kľúčový rozdiel medzi RNASE A a RNASE H je v tom, že RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky degraduje jednovláknovú RNA na menšie zložky, zatiaľ čo RNáza H je nešpecifický enzým, ktorý štiepi RNA v hybride RNA-DNA na menšie jednotky prostredníctvom hydrolytický mechanizmus.
OBSAH
1. Prehľad a kľúčový rozdiel
2. Čo je RNASE A
3. Čo je RNASE H
4. Podobnosti medzi RNASE A a RNASE H
5. Porovnanie vedľa seba - RNASE A vs RNASE H v tabuľkovej forme
6. Zhrnutie
Čo je RNASE A?
RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi nepárové zvyšky cytozínu a uracilu na 3 'konci jednovláknovej RNA. RNáza H pracuje pri vyššej koncentrácii soli (0,3 M alebo vyššia koncentrácia NaCl). Hydrolytická reakcia je dvojstupňová. Tvorí 3 'fosforylovaný produkt prostredníctvom 2', 3 'cyklického monofosfátového medziproduktu. Aj keď je špecifický pre jednovláknovú RNA pri vyššej koncentrácii solí, môže tiež degradovať dvojvláknovú RNA a RNA v hybride RNA-DNA pri nižšej koncentrácii NaCl (nižšej ako 0,3 M NaCI).
Bruce Merrifield najskôr syntetizoval tento enzým. RNáza A je veľmi populárny enzým v molekulárnom výskume. Hovädzia pankreatická RNáza A je príkladom RNázy A. A je to jeden z najtvrdších enzýmov, ktoré sa používajú v laboratóriu. Tento enzým pre svoju aktivitu nepotrebuje kofaktor. Je to vysoko termostabilný enzým. RNáza A je prvý enzým a tretí proteín, ktorému bola detegovaná správna sekvencia aminokyselín. Tento enzým je veľmi malý, má 124 aminokyselín a molekulovú hmotnosť 1 600da. A má štyri zvyšky histidínu (His 12 a His 119, ktoré sa zúčastňujú katalytickej reakcie).
Obrázok 01: RNáza A
RNáza A sa môže izolovať varením surovej vzorky. Pri varení všetky ostatné enzýmy degradujú zvyšnú RNázu A. RNáza A je neuveriteľne stabilný enzým. Tento enzým inhibuje s komplexom proteínov inhibítora ribonukleázy, komplexov ťažkých kovov a uridín-vanadátu.
Čo je RNáza H?
RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže hydrolytickou reakciou degradovať RNA v hybride RNA-DNA. RNáza H štiepi 3'-OP väzbu RNA v hybride RNA-DNA. Nakoniec produkuje produkty zakončené 3'OH a 5 'fosfátmi. Pri replikácii DNA hrá kľúčovú úlohu tým, že odstráni RNA primer po vytvorení nových vlákien DNA. V laboratórnych podmienkach špecificky degraduje RNA v hybride RNA-DNA, ale nie v DNA a nehybridizovanej RNA. A tento enzým sa zvyčajne používa na zničenie templátu RNA potom, čo sa počas syntézy cDNA vytvorí prvý komplementárny reťazec DNA.
Obrázok 02: RNáza H
RNáza H sa tiež používa v testoch ochrany pred nukleázou. Môže sa tiež začleniť do odstránenia konca poly A z mRNA. RNáza H má schopnosť deštruovať nekódujúcu RNA vo vnútri aj mimo bunky. Kovové ióny sú potrebné ako kofaktory pre túto aktivitu proteínu. Na inhibíciu enzýmu RNáza H sa môže použiť chelátor (EDTA).
Aké sú podobnosti medzi RNASE A a RNASE H?
- Oba majú bielkovinovú povahu.
- Obidve sú endoribonukleázou
- Oba môžu degradovať RNA.
- Oba uskutočňujú hydrolytické reakcie.
- Molekulárne laboratóriá používajú obe tieto metódy.
Aký je rozdiel medzi RNASE A a RNASE H?
Rozdielny článok v strede pred tabuľkou
RNASE A vs RNASE H |
|
| RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi 3 'koniec nespárovaných zvyškov cytosínu a uracilu jednovláknovej RNA pri vyššej koncentrácii solí. | RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže hydrolytickou reakciou degradovať RNA v hybride RNA-DNA. |
| Povaha štiepenia RNA | |
| RNáza A špecificky štiepi jednovláknovú RNA pri vyššej koncentrácii soli. | RNáza H štiepi RNA v hybride RNA-DNA. |
| Potreba kofaktorov pre činnosť | |
| RNáza A nepotrebuje pre svoju činnosť kofaktory. | RNáza H potrebuje pre svoju činnosť iónové kovy ako kofaktory. |
| Inhibítory aktivity proteínov | |
| Komplexy proteínu inhibítora ribonukleázy, komplexov ťažkých kovov a uridín vanadičnanu inhibujú aktivitu RNAázy A. | Chelátor (EDTA) inhibuje aktivitu RNázy H. |
| Odstránenie primerov RNA pri replikácii DNA | |
| RNáza A sa nepoužíva na odstránenie primerov RNA pri replikácii DNA. | RNáza H sa používa na odstránenie RNA priméru pri replikácii DNA |
| Odstránenie šablóny DNA v syntéze komplementárnej DNA (C-DNA) | |
| RNáza A sa nepoužíva na odstránenie templátu RNA počas syntézy komplementárnej DNA (C-DNA). | RNáza H sa používa na odstránenie templátu RNA počas syntézy komplementárnej DNA (C-DNA). |
| Odstránenie poly-A-chvosta v mRNA hybridizovanej na oligo (dt) | |
| RNáza A sa nepoužíva na odstránenie „poly-A konca“v mRNA hybridizovanej s oligo (dt). | RNáza H sa používa na odstránenie „poly-A konca“v mRNA hybridizovanej s oligo (dt) |
Zhrnutie - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleázy sú nukleázové enzýmy, ktoré majú schopnosť štiepiť RNA na menšie jednotky. Sú to dva typy; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, ktorá má schopnosť degradovať jednovláknovú alebo dvojvláknovú RNA. A štiepi fosfodiesterovú väzbu v polynukleotidovom reťazci RNA. RNáza A a RNáza H sú dve endoribonukleázy. RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi nepárové zvyšky cytozínu a uracilu na 3 'konci jednovláknovej RNA pri vyššej koncentrácii soli. RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže hydrolytickou reakciou degradovať RNA v hybride RNA-DNA. To je rozdiel medzi RNázou A a RNázou H.
Stiahnite si PDF RNASE A vs RNASE H
Môžete si stiahnuť verziu tohto článku vo formáte PDF a použiť ho na offline účely podľa citačnej poznámky. Stiahnite si tu PDF verziu. Rozdiel medzi RNASE A a RNASE H
