Rozdiel Medzi RNASE A A RNASE H

2024 Autor: Mildred Bawerman | [email protected]. Naposledy zmenené: 2023-12-16 08:42

Kľúčový rozdiel - RNASE A vs RNASE H

Ribonukleázy sú nukleázy, ktoré špecificky degradujú RNA na menšie jednotky. Možno ich rozdeliť do dvoch kategórií; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, ktorá môže degradovať jednovláknovú alebo dvojvláknovú RNA. Štiepi fosfodiesterové väzby v RNA polynukleotidovom reťazci. Príklady sú RNáza A, RNáza III, RNáza T1, RNáza P a RNáza H. Exoribonukleáza je exonukleáza, ktorá degraduje RNA odstránením koncových nukleotidov buď z 5 'konca alebo 3' konca molekuly RNA. Príklady sú RNáza R, RNáza II, RNáza D a RNáza PH. Kľúčový rozdiel medzi RNASE A a RNASE H je v tom, že RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky degraduje jednovláknovú RNA na menšie zložky, zatiaľ čo RNáza H je nešpecifický enzým, ktorý štiepi RNA v hybride RNA-DNA na menšie jednotky prostredníctvom hydrolytický mechanizmus.

OBSAH

1. Prehľad a kľúčový rozdiel

2. Čo je RNASE A

3. Čo je RNASE H

4. Podobnosti medzi RNASE A a RNASE H

5. Porovnanie vedľa seba - RNASE A vs RNASE H v tabuľkovej forme

6. Zhrnutie

Čo je RNASE A?

RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi nepárové zvyšky cytozínu a uracilu na 3 'konci jednovláknovej RNA. RNáza H pracuje pri vyššej koncentrácii soli (0,3 M alebo vyššia koncentrácia NaCl). Hydrolytická reakcia je dvojstupňová. Tvorí 3 'fosforylovaný produkt prostredníctvom 2', 3 'cyklického monofosfátového medziproduktu. Aj keď je špecifický pre jednovláknovú RNA pri vyššej koncentrácii solí, môže tiež degradovať dvojvláknovú RNA a RNA v hybride RNA-DNA pri nižšej koncentrácii NaCl (nižšej ako 0,3 M NaCI).

Bruce Merrifield najskôr syntetizoval tento enzým. RNáza A je veľmi populárny enzým v molekulárnom výskume. Hovädzia pankreatická RNáza A je príkladom RNázy A. A je to jeden z najtvrdších enzýmov, ktoré sa používajú v laboratóriu. Tento enzým pre svoju aktivitu nepotrebuje kofaktor. Je to vysoko termostabilný enzým. RNáza A je prvý enzým a tretí proteín, ktorému bola detegovaná správna sekvencia aminokyselín. Tento enzým je veľmi malý, má 124 aminokyselín a molekulovú hmotnosť 1 600da. A má štyri zvyšky histidínu (His 12 a His 119, ktoré sa zúčastňujú katalytickej reakcie).

Obrázok 01: RNáza A

RNáza A sa môže izolovať varením surovej vzorky. Pri varení všetky ostatné enzýmy degradujú zvyšnú RNázu A. RNáza A je neuveriteľne stabilný enzým. Tento enzým inhibuje s komplexom proteínov inhibítora ribonukleázy, komplexov ťažkých kovov a uridín-vanadátu.

Čo je RNáza H?

RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže hydrolytickou reakciou degradovať RNA v hybride RNA-DNA. RNáza H štiepi 3'-OP väzbu RNA v hybride RNA-DNA. Nakoniec produkuje produkty zakončené 3'OH a 5 'fosfátmi. Pri replikácii DNA hrá kľúčovú úlohu tým, že odstráni RNA primer po vytvorení nových vlákien DNA. V laboratórnych podmienkach špecificky degraduje RNA v hybride RNA-DNA, ale nie v DNA a nehybridizovanej RNA. A tento enzým sa zvyčajne používa na zničenie templátu RNA potom, čo sa počas syntézy cDNA vytvorí prvý komplementárny reťazec DNA.

Obrázok 02: RNáza H

RNáza H sa tiež používa v testoch ochrany pred nukleázou. Môže sa tiež začleniť do odstránenia konca poly A z mRNA. RNáza H má schopnosť deštruovať nekódujúcu RNA vo vnútri aj mimo bunky. Kovové ióny sú potrebné ako kofaktory pre túto aktivitu proteínu. Na inhibíciu enzýmu RNáza H sa môže použiť chelátor (EDTA).

Aké sú podobnosti medzi RNASE A a RNASE H?

• Oba majú bielkovinovú povahu.
• Obidve sú endoribonukleázou
• Oba môžu degradovať RNA.
• Oba uskutočňujú hydrolytické reakcie.
• Molekulárne laboratóriá používajú obe tieto metódy.

Aký je rozdiel medzi RNASE A a RNASE H?

Rozdielny článok v strede pred tabuľkou

RNASE A vs RNASE H
RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi 3 'koniec nespárovaných zvyškov cytosínu a uracilu jednovláknovej RNA pri vyššej koncentrácii solí.	RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže hydrolytickou reakciou degradovať RNA v hybride RNA-DNA.
Povaha štiepenia RNA
RNáza A špecificky štiepi jednovláknovú RNA pri vyššej koncentrácii soli.	RNáza H štiepi RNA v hybride RNA-DNA.
Potreba kofaktorov pre činnosť
RNáza A nepotrebuje pre svoju činnosť kofaktory.	RNáza H potrebuje pre svoju činnosť iónové kovy ako kofaktory.
Inhibítory aktivity proteínov
Komplexy proteínu inhibítora ribonukleázy, komplexov ťažkých kovov a uridín vanadičnanu inhibujú aktivitu RNAázy A.	Chelátor (EDTA) inhibuje aktivitu RNázy H.
Odstránenie primerov RNA pri replikácii DNA
RNáza A sa nepoužíva na odstránenie primerov RNA pri replikácii DNA.	RNáza H sa používa na odstránenie RNA priméru pri replikácii DNA
Odstránenie šablóny DNA v syntéze komplementárnej DNA (C-DNA)
RNáza A sa nepoužíva na odstránenie templátu RNA počas syntézy komplementárnej DNA (C-DNA).	RNáza H sa používa na odstránenie templátu RNA počas syntézy komplementárnej DNA (C-DNA).
Odstránenie poly-A-chvosta v mRNA hybridizovanej na oligo (dt)
RNáza A sa nepoužíva na odstránenie „poly-A konca“v mRNA hybridizovanej s oligo (dt).	RNáza H sa používa na odstránenie „poly-A konca“v mRNA hybridizovanej s oligo (dt)

Zhrnutie - RNASE A vs RNASE H

Ribonukleázy sú nukleázové enzýmy, ktoré majú schopnosť štiepiť RNA na menšie jednotky. Sú to dva typy; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, ktorá má schopnosť degradovať jednovláknovú alebo dvojvláknovú RNA. A štiepi fosfodiesterovú väzbu v polynukleotidovom reťazci RNA. RNáza A a RNáza H sú dve endoribonukleázy. RNáza A je pankreatická ribonukleáza, ktorá špecificky štiepi nepárové zvyšky cytozínu a uracilu na 3 'konci jednovláknovej RNA pri vyššej koncentrácii soli. RNáza H je nešpecifický ribonukleázový enzým, ktorý môže hydrolytickou reakciou degradovať RNA v hybride RNA-DNA. To je rozdiel medzi RNázou A a RNázou H.

Stiahnite si PDF RNASE A vs RNASE H

Môžete si stiahnuť verziu tohto článku vo formáte PDF a použiť ho na offline účely podľa citačnej poznámky. Stiahnite si tu PDF verziu. Rozdiel medzi RNASE A a RNASE H