Kľúčový rozdiel medzi prokaryotickými a eukaryotickými ribozómami je ten, že prokaryotické ribozómy sú častice 70S zložené z 50S veľkej podjednotky a 30S malej podjednotky, zatiaľ čo eukaryotické ribozómy sú 80S častice zložené z 60S veľkej podjednotky a 40S malej podjednotky.
Prokaryoty a eukaryoty sú dve hlavné skupiny živých organizmov, ktoré sa líšia od bunkovej organizácie. Prokaryoty neobsahujú bunkové organely viazané na jadro a membránu. Na druhej strane eukaryoty vlastnia bunkové organely spojené s jadrom a membránou. Existujú niektoré organely spoločné pre oba organizmy. Ribozóm je jednou z dôležitých a vitálnych organel prítomných v prokaryotických aj eukaryotických bunkách. Sú prítomné v cytoplazme každej bunky. Štrukturálne bielkoviny a ribozomálna RNA (rRNA) tvoria ribozómy. Skladajú sa z dvoch podjednotiek, a to väčšej podjednotky a malej podjednotky. Vykonávajú tiež rovnakú funkciu, ktorou je translácia molekúl mRNA do proteínov. Pretože preklad je životne dôležitý proces pre všetky živé organizmy a vyskytuje sa v ribozómoch,ribozómy sú veľmi dôležité pre prokaryoty aj eukaryoty. Napriek mnohým podobnostiam existujú určité rozdiely medzi prokaryotickými a eukaryotickými ribozómami.