Kľúčový rozdiel medzi aktinomykózou a aktinobacilózou je v tom, že aktinomykóza je infekčné ochorenie spôsobené grampozitívnymi vláknitými Actinomyces spp. Naproti tomu aktinobacilóza je infekčné ochorenie spôsobené gramnegatívnym tyčinkovým Actinobacillus spp.
Aktinomykóza a aktinobacilóza sú dve infekčné ochorenia spôsobené baktériami. Actinomyces spp sú pôvodcami baktérií aktinomykózy. Sú grampozitívne, vláknité, nekyslo-rýchle a anaeróbne až mikroaerofilné baktérie. Aktinomykóza môže ovplyvňovať tvár, kosti a kĺby, dýchacie cesty, urogenitálny trakt, zažívací trakt, centrálny nervový systém, pokožku a štruktúry mäkkých tkanív. Naproti tomu Actinobacillus spp. Sú pôvodcami aktinobacilózy. Actinobacillus spp sú gramnegatívne, nepohyblivé, nespórotvorné a oválne až tyčinkovité baktérie. Aktinomykóza zvyčajne vzniká v tvrdých tkanivách, zatiaľ čo aktinobacilóza zvyčajne v mäkkých tkanivách.