Kľúčový rozdiel medzi cytochrómom a fytochrómom spočíva v tom, že cytochróm je hemový proteín prenosu elektrónov zapojený do aeróbneho dýchania. Medzitým je fytochróm fotoreceptorový proteín, ktorý je citlivý na červené a ďaleko červené svetlo viditeľného spektra.
Živé organizmy majú rôzne druhy pigmentov. Niektoré sú pigmenty absorbujúce svetlo, zatiaľ čo iné sú pigmenty na dýchanie. Cytochróm je metaloproteín, ktorý funguje ako nosič elektrónov v aeróbnom dýchaní. Medzitým je fytochróm fotoreceptor, ktorý absorbuje červené a ďaleko červené svetlo z viditeľného spektra. V porovnaní s cytochrómom sú fytochrómy dôležité v mnohých aspektoch vývoja rastlín.
