Kľúčovým rozdielom medzi hybridnými a zdegenerovanými orbitalmi je to, že hybridné orbitaly sú nové orbitaly, ktoré vznikajú zmiešaním dvoch alebo viacerých orbitalov, zatiaľ čo degenerované orbitaly pôvodne existujú v atóme.
Ako už z jeho názvu vyplýva, hybridný orbitál je hybridom dvoch alebo viacerých orbitalov. Aj keď sa názov degenerovaný orbitál zdá byť rovnaký, nejde o novovzniknuté orbitaly - už existujú v atóme. Navyše všetky hybridné orbitaly v molekule majú rovnakú energiu, zatiaľ čo degenerované orbitaly v atóme majú rovnakú energiu.
