Kľúčovým rozdielom medzi fermentáciou v pevnom stave a ponorenou fermentáciou je, že fermentácia v pevnom stave spočíva v kultivácii mikroorganizmov na pevnom substráte s nízkym obsahom vlhkosti, zatiaľ čo ponorná fermentácia spočíva v kultivácii mikroorganizmov v kvapalnom médiu, ktoré má viac ako 95% obsahu vody..
Mikroorganizmy sú prospešné v rôznych druhoch priemyselných odvetví. Baktérie a huby majú v priemyselných odvetviach predovšetkým široké použitie. Mikroorganizmy by sa mali pestovať vo veľkom meradle počas procesu priemyselnej fermentácie, aby sa získali potrebné produkty, ktoré sú výsledkom mikrobiálneho metabolizmu. Fermentácia v pevnom stave a ponorená fermentácia sú dva hlavné typy fermentácie, ktoré pomáhajú priemyselne vyrábať enzýmy. Pri fermentácii v pevnom stave k fermentácii dochádza mikroorganizmami pestovanými na pevnom substráte, zatiaľ čo pri ponorenej fermentácii k fermentácii dochádza mikroorganizmami pestovanými v kvapalnom médiu. Každá metóda má výhody aj nevýhody.
