Kľúčovým rozdielom medzi vírusom a viroidmi je, že vírus je obligátnym parazitom zloženým z genómu RNA alebo DNA a proteínovej kapsidy, zatiaľ čo viroidy sú infekčné častice zložené z jednovláknových kruhových molekúl RNA.
Existujú rôzne typy infekčných agensov, ktoré spôsobujú choroby rastlín, zvierat a iných organizmov. Z nich sú dobre známe infekčné činidlá baktérie, huby, prvoky, vírusy, viroidy a prióny. Vírusy a viroidy sú veľmi malé častice. Oba typy sú obligátne parazity. Vírus obsahuje RNA alebo DNA genóm obklopený proteínovou kapsidou. Viroidy sú však jednovláknové cirkulárne molekuly RNA. Neobsahujú bielkovinové kapsidy. Rovnako existuje veľa významných rozdielov medzi vírusom a viroidmi. Tento článok sa preto venuje skúmaniu rozdielov medzi vírusom a viroidmi.
