Kľúčový rozdiel medzi DNA a cDNA spočíva v tom, že DNA obsahuje exóny aj intróny, zatiaľ čo cDNA obsahuje iba exóny.
DNA a cDNA sú dva typy nukleových kyselín, ktoré sú tvorené deoxyribonukleotidmi. DNA je jednou z najdôležitejších makromolekúl živých organizmov, ktoré tvoria genóm. Genóm obsahuje celkovú genetickú informáciu organizmu. Tvoria rôzne typy sekvencií vrátane exónov, ktoré sú kódujúcimi sekvenciami, a intrónov, ktoré nie sú kódujúcimi sekvenciami. Na druhej strane je cDNA alebo komplementárna DNA ďalšou formou DNA, ktorú vedci umelo syntetizujú z molekúl mRNA. Pretože cDNA pochádza z mRNA templátov, neobsahuje nekódujúce sekvencie ani intróny.
