Kľúčovým rozdielom medzi tardívnou dyskinézou a dystóniou je, že tardívna dyskinéza je vždy sekundárna pri dlhodobom užívaní neuroleptík, ale dystónia môže byť spôsobená rôznymi inými príčinami. Ďalej, dystónia je abnormálny svalový tonus, ktorý vedie k svalovým kŕčom alebo neobvyklému držaniu tela. Zatiaľ čo tardívna dyskinéza označuje nekontrolovateľné grimasy vyrážajúce do úst a plácajúce na pery, ktoré sa vyvíjajú po dlhodobom užívaní neuroleptík.
Oba tieto stavy sú abnormálne poruchy pohybu; dystónie zahŕňajú rôzne pohybové poruchy, ktoré sa vyskytujú z rôznych dôvodov, zatiaľ čo tardívna dyskinéza je iba podskupinou primárnych dystónií.