Kľúčový rozdiel medzi konfiguráciou R a S spočíva v tom, že konfigurácia R je priestorové usporiadanie R izoméru, ktoré má relatívny smer prioritného poradia v smere hodinových ručičiek, zatiaľ čo konfigurácia S je priestorové usporiadanie S izoméru, ktorý má relatívny smer priority. poradie proti smeru hodinových ručičiek. Tu je relatívny smer poradia priorít zostupné poradie priorít substituentov.
Izoméry R a S sú organické molekuly, ktoré majú chirálne centrum, čo je atóm uhlíka, ktorý má k sebe pripojené štyri rôzne substituenty. Tieto substituenty sa uvedú podľa ich priority (priorita sa určuje pomocou pravidiel CIP, ako je opísané nižšie).