Kľúčovým rozdielom medzi bázou a nukleofilom je, že bázy sú akceptory vodíka, ktoré môžu vykonávať neutralizačné reakcie, zatiaľ čo nukleofily útočia na elektrofily, aby iniciovali určité organické reakcie.
Kyseliny a zásady sú dva dôležité pojmy v chémii. Oba majú protichodné vlastnosti. Nukleofil je pojem, ktorý v organickej chémii výraznejšie používame na opísanie reakčných mechanizmov a rýchlostí. Štrukturálne nie je zreteľný rozdiel medzi bázou a nukleofilom, ale funkčne vykonávajú rôzne povinnosti.