Kľúčový rozdiel medzi genómom a genofondom spočíva v tom, že genóm sa vzťahuje na celú DNA organizmu, zatiaľ čo génový fond sa vzťahuje na kompletný súbor jedinečných génov populácie krížencov.
Gén je základnou štruktúrnou jednotkou dedičnosti. Gény prechádzajú z rodiča na potomka prostredníctvom gamét. Sú tiež prítomné v genóme organizmu. Genóm je úplná sada DNA organizmu. Génový bazén je tiež podobný pojem. Predstavuje však súbor všetkých génov prítomných v populácii alebo druhu. Na rozdiel od genómu je genofond zmesou génov populácie. Genofond teda predstavuje všetky možné alely prítomné v konkrétnej populácii.
