Kľúčový rozdiel - upstream vs downstream DNA
Je dôležité mať všeobecné vedomosti o zložení a štruktúre DNA, aby ste pochopili rozdiel medzi upstream a downstream DNA. DNA je zložená z polynukleotidových reťazcov. Nukleotidy sú stavebnými blokmi, ktoré vytvárajú polynukleotidové reťazce a každý nukleotid je tvorený z troch zložiek: päťuhlíkového cukru, dusíkatej zásady a fosfátovej skupiny. Fosfátová skupina a skupina OH sú pripojené k 5 'pozícii uhlíka a 3' polohe uhlíka molekuly cukru v nukleotide. Nukleotidy sú spojené fosfodiesterovými väzbami vytvorenými medzi 5 'fosfátovou skupinou jedného nukleotidu a 3' OH skupinou susedného nukleotidu. Pokiaľ má polynukleotidový reťazec voľnú 5 'fosfátovú skupinu, je označený ako 5' koniec; ak má voľnú 3 'OH skupinu, je označená ako 3' koniec. PretoVlákna DNA majú obvykle 5 'a 3' konce podľa koncových polôh polynukleotidových reťazcov. DNA existuje aj ako dvojvláknová forma. Dva pramene sú navzájom antiparalelné. Preto má DNA dve vlákna, ktoré prebiehajú v smere 5 'až 3' a 3 'až 5'. Upstream a downstream DNA sa označuje s odkazom na transkripciu a syntézu 5 'až 3' mRNA vlákna. Ak sa DNA považuje za 5 koniec kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako upstream DNA. Pokiaľ je DNA považovaná za 3 'koniec od kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako downstream DNA. Toto je kľúčový rozdiel medzi DNA proti smeru toku a proti prúdu. Dva pramene sú navzájom antiparalelné. Preto má DNA dve vlákna, ktoré prebiehajú v smere 5 'až 3' a 3 'až 5'. Upstream a downstream DNA sa označuje s odkazom na transkripciu a syntézu 5 'až 3' mRNA vlákna. Ak sa DNA považuje za 5 koniec kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako upstream DNA. Pokiaľ je DNA považovaná za 3 'koniec od kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako downstream DNA. Toto je kľúčový rozdiel medzi DNA proti smeru toku a proti prúdu. Dva pramene sú navzájom antiparalelné. Preto má DNA dve vlákna, ktoré prebiehajú v smere 5 'až 3' a 3 'až 5'. Upstream a downstream DNA sa označuje s odkazom na transkripciu a syntézu 5 'až 3' mRNA vlákna. Ak sa DNA považuje za 5 koniec kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako upstream DNA. Ak sa DNA považuje za 3 'koniec od kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako downstream DNA. Toto je kľúčový rozdiel medzi DNA proti smeru toku a proti prúdu. Ak sa DNA považuje za 5 koniec kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako upstream DNA. Pokiaľ je DNA považovaná za 3 'koniec od kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako downstream DNA. Toto je kľúčový rozdiel medzi DNA proti smeru toku a proti prúdu. Ak sa DNA považuje za 5 koniec kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako upstream DNA. Pokiaľ je DNA považovaná za 3 'koniec od kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie, je známa ako downstream DNA. Toto je kľúčový rozdiel medzi DNA proti smeru toku a proti prúdu.
OBSAH
1. Prehľad a hlavný rozdiel
2. Čo je upstream DNA
3. Čo je downstream DNA
4. Porovnanie vedľa seba - upstream vs downstream DNA
5. Zhrnutie
Čo je upstream DNA?
Gén je dedičnosť štruktúrnej a funkčnej jednotky, ktorá sa nachádza na DNA organizmu. Je uložený s pokynmi na skonštruovanie proteínu. Gén má špecifickú oblasť molekuly DNA. Ak je to potrebné, prepisuje sa a prevádza sa na proteín syntézou vlákna mRNA. Normálne kódujúce vlákno génu vedie od 5 'do 3' smeru. Keď je transkribovaný, produkuje mRNA vlákno v rovnakom smere od 5 'do 3'. Počas transkripcie sa 3 'až 5' antisense vlákno slúži ako templátové vlákno a iniciuje syntézu mRNA. V géne je transkripčné iniciačné miesto. S odkazom na miesto začatia transkripcie je oblasť DNA smerom k 5 'koncu kódujúceho vlákna známa ako upstream DNA. Promótor génu je normálne umiestnený v upstream oblasti DNA. V eukaryotických génochv oblasti pred génom sú TATA boxy, proximálne prvky promótora a zosilňovače. Protiľahlá oblasť génu je označená zápornými číslami. Upstream DNA génu je nanajvýš dôležitá pre transkripciu.
Čo je downstream DNA?
Miesto začatia transkripcie je známe ako +1 bod génu. Oblasť DNA od +1 bodu smerom k 3 'koncu kódujúceho vlákna je známa ako downstream DNA. Inými slovami, downstream od génu je od miesta začatia transkripcie smerom k 5 'koncu templátového vlákna. Následná DNA génovej oblasti preto zahrnuje transkripčnú jednotku a ďalšie sekvencie, ako je napríklad terminátorová sekvencia. Promótor môže ovplyvňovať následnú sekvenciu génu. Následná časť génu sa označuje ako kladné číslo. Následná DNA génu je skutočná oblasť, ktorá poskytuje proteínový produkt.
Obrázok 01: Upstream a Downstream DNA
Aký je rozdiel medzi upstream a downstream DNA?
Rozdielny článok v strede pred tabuľkou
Upstream vs Downstream DNA |
|
| Oblasť DNA smerom k 5 'koncu kódujúcej sekvencie od miesta začatia transkripcie je známa ako upstream DNA. | Oblasť DNA smerom k 3 'koncu kódujúceho vlákna z miesta začatia transkripcie je známa ako downstream DNA. |
| Prvky | |
| Promótory a zosilňovače sú umiestnené na protiprúdovej DNA | Transkripčná jednotka a terminátorové sekvencie sú umiestnené v DNA po smere. |
| Číslovanie | |
| Nukleotidy v upstream oblasti sú označené zápornými číslami | Nukleotidy sú označené kladnými číslami. |
| Funkcia | |
| Táto oblasť obsahuje prvky potrebné na reguláciu a spustenie transkripcie | Táto oblasť obsahuje inštrukcie na produkciu proteínu a ukončenie transkripcie |
Zhrnutie - upstream vs downstream DNA
Je ľahké identifikovať pred a za reťazcom RNA. Pokiaľ ide o referenčné miesto, oblasť smerom k 5 'koncu reťazca RNA je známa ako upstream RNA, zatiaľ čo oblasť smerom k 3' koncu je známa ako downstream RNA. V DNA však existujú dve vlákna, ktoré prebiehajú v oboch smeroch 5 'až 3' a 3 'až 5'. Preto je rozdiel medzi DNA proti smeru a smerom nadol komplikovaný. Preto je diferencovaný s odkazom na transkripciu génu. Z miesta začatia transkripcie smerom k 5 koncu sense vlákna je oblasť DNA známa ako upstream DNA, zatiaľ čo z miesta začatia transkripcie smerom k 3 'koncu sense vlákna je známa ako DNA downstream. To je rozdiel medzi DNA proti prúdu a za ním.
